Även efter tusentals år visar arkitekturen i Knossos fortfarande hur smarta minoerna var. Palatset var byggt runt en stor central gård, från vilken korridorer ledde in i en labyrint av rum som användes för allt från förvaring och verkstäder till bostäder och religiösa ritualer.
Berättelsen om Knossos var bland de första kända komplexen i Europa som hade en design med flera våningar. Flera våningar var förbundna med Stora trappor och ljusbrunnar, vilket gjorde att naturligt ljus och luftflöde kunde nå de inre utrymmena, en förvånansvärt modern komfort under bronsåldern.
Många rum hade specifika syften: långa magasin för förvaring av spannmål och olja, lustrala bassänger för rituell rengöring och utsmyckade kammare som drottningens megaron och rummet med tronen, som sannolikt fungerade som ett utrymme för ceremoniella sammankomster eller för kunglig auktoritet att visas upp.